Windows10环境下R的file.exists()返回false但目标文件实际存在问题

问题复现 #

你提供的运行代码如下：

setwd("C:/Users/ronyj/R_projects/itro_to_bioinformatics/tut_3_fasta")

getwd()
#> "C:/Users/ronyj/R_projects/itro_to_bioinformatics/tut_3_fasta"

file.exists("wuhan_covid_genome.fasta")
#> FALSE

file.exists("C:/Users/ronyj/R_projects/itro_to_bioinformatics/tut_3_fasta/wuhan_covid_genome.fasta")
#> FALSE

你确认文件存放在对应文件夹，截图如下：

排查步骤按优先级执行： #

• 解决Windows扩展名隐藏问题
  Windows默认隐藏已知文件的扩展名，你看到的.fasta大概率是文件名的一部分，真实文件后缀可能是.fasta.txt，导致路径不匹配：
  • 打开文件资源管理器顶部「查看」标签，勾选「文件扩展名」选项
  • 查看目标文件的真实全名，修正代码中的文件名即可
• 列出R可识别的目录文件
  运行以下代码输出当前工作目录下R能读取到的所有文件，直接核对是否有目标文件，同时可以复制输出的文件名避免拼写错误：

list.files()

• 检查路径拼写错误
  注意你代码中路径的itro_to_bioinformatics字段，大概率是将正确的intro_to_bioinformatics少写了首字母n，核对每个文件夹的真实名称，避免拼写偏差。
• 验证文件夹读取权限
  右键点击目标文件夹，选择「属性」-「安全」，确认当前运行R的Windows账户拥有「读取、列出文件夹内容」权限，无权限的话修改对应权限配置即可。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Rony Juliusburger