使用ggpubr的stat_compare_means做组间检验时如何添加对比括号

你原来的写法默认仅展示统计值，不会自动生成组间对比的括号连接线。如果需要保留stat_compare_means()中aes(group = supp)的参数设定，同时输出带括号的效果，添加bracket.group.by参数即可实现，完整代码如下：

library(ggpubr)
data("ToothGrowth")
p <- ggboxplot(ToothGrowth, x = "dose", y = "len",
          color = "supp", palette = "jco",
          add = "jitter")
p + stat_compare_means(aes(group = supp), 
                       bracket.group.by = "dose", # 按x轴dose分组，在每组内生成对比括号
                       label = "p.format") # 可替换为p.signif显示显著性星号

可选调整参数 #

• 若括号与数据点重叠，可添加label.y参数手动指定括号的垂直位置，示例：label.y = c(30, 36, 42) 可分别为三个dose水平的括号设置不同高度
• 若运行报错，可先更新ggpubr到最新版本：install.packages("ggpubr")

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Jeff238