如何在R语言metafor库中反转漏斗图（funnel plot）的Y轴顺序

解决方法 #

你之前仅修改ylim参数不生效的原因是metafor的funnel()函数内部会自动匹配Y轴刻度和数值范围，不会因为范围反转就自动调整标签逻辑，可按以下两种方案实现需求： #

方案1：使用新版metafor自带参数（推荐）

如果你的metafor版本≥3.0-0，直接添加yrev = TRUE参数即可自动反转Y轴：

library("metafor")
funnel(x = prumer$AVGT, sei = prumer$invSE, 
       xlab = "Observed effect", ylab = "1/SE", 
       xlim = c(-3, 3), yrev = TRUE)

补充说明：如果你希望Y轴直接显示精度（1/SE），不需要提前计算invSE再传给sei参数，只需把效应量原始标准误传给sei，再添加yaxis = "prec"参数即可自动计算并显示精度值。

方案2：手动自定义Y轴（适配所有版本）

如果是旧版本没有yrev参数，可以关闭默认Y轴后手动添加降序刻度：

library("metafor")
# 绘制基础漏斗图，关闭默认Y轴输出
funnel(x = prumer$AVGT, sei = prumer$invSE, 
       xlab = "Observed effect", ylab = "1/SE", 
       xlim = c(-3, 3), ylim = c(2500, 0), yaxt = "n")
# 手动添加降序Y轴刻度，seq的步长可根据你的数据范围调整
axis(side = 2, at = seq(0, 2500, 500), labels = rev(seq(0, 2500, 500)))

内容的提问来源于stack exchange，提问作者vojtam