R包runjags的run.jags函数并行核心占用量及自定义配置问题

默认核心调用规则 #

当你使用run.jags的并行运行模式时，默认调用的核心数和你设置的MCMC链数（n.chains参数）保持一致，同时不会超出你设备的可用物理核心上限。
以你的4核CPU设备为例：

• 如果你设置了4条MCMC链，默认就会调用全部4核并行运行
• 如果你设置了2条MCMC链，默认只会调用2核
• 未开启并行模式时，默认仅使用1核运行

自定义核心数的方法 #

你完全可以自行指定调用的核心数量，只需在调用run.jags()时同时配置method和n.cores两个参数即可：

• 强制使用全部4核：传入参数method = "parallel", n.cores = 4，建议同时将n.chains设为4，避免单核心运行多条链产生额外开销
• 仅使用2核：传入参数method = "parallel", n.cores = 2
• 仅使用3核：传入参数method = "parallel", n.cores = 3

注意：指定的核心数不要超过设备的物理核心总数，否则会因为核心资源争抢、调度开销增大反而降低运行效率

内容的提问来源于stack exchange，提问作者JasonYeung