如何使用awk等工具提取SRMAPQ数值大于60的dataframe数据行

以下命令支持SRMAPQ字段出现在行任意位置的场景，直接运行即可得到预期筛选结果：

awk 'match($0, /SRMAPQ=([0-9]+)/, arr) && arr[1] > 60' 你的目标文件名

命令说明 #

• match($0, /SRMAPQ=([0-9]+)/, arr) 会扫描整行内容，匹配SRMAPQ=后跟随的数字，将捕获到的数值存入数组arr的第1位
• 仅当匹配到SRMAPQ字段且对应数值大于60时，整行才会被输出
• 如果你的环境是不支持match第三个参数的低版本awk，可以使用兼容版本命令：

awk 'match($0, /SRMAPQ=([0-9]+)/) {val=substr($0, RSTART+7, RLENGTH-7); if(val>60) print}' 你的目标文件名

内容的提问来源于stack exchange，提问作者SG Kwon