Mac OS BigSur系统下R无法安装rstan等包的问题求助

步骤1：排查网络问题 #

• 先关闭当前系统运行的代理、VPN工具，macOS BigSur对第三方网络工具的权限限制会阻断R的HTTPS请求，确认系统本身可以正常访问公共网页后再测试R装包。

步骤2：使用合法CRAN源测试装包 #

你当前混用了HTTP和HTTPS源，R 4.0+版本默认仅支持HTTPS协议的CRAN源，HTTP源会触发重定向报错，直接在R控制台执行以下命令测试基础包安装：

install.packages("dplyr", repos = "https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/", type = "binary")

注：指定type = "binary"会直接下载预编译的二进制包，无需本地编译，可大幅降低安装报错概率

步骤3：重置R启动配置文件 #

无需安装usethis包，直接通过Mac终端操作即可重置损坏的启动配置：

1. 完全关闭所有R相关进程（包括R.app、RStudio）
2. 打开「终端」应用，依次执行以下命令：

# 备份现有配置文件，后续可按需恢复
mv ~/.Rprofile ~/.Rprofile_backup
mv ~/.Renviron ~/.Renviron_backup
# 移除旧版本R的包缓存，避免版本兼容冲突
rm -rf ~/Library/R/4.0/library

3. 重新打开R，再次执行步骤2的装包命令测试。

步骤4：升级R版本适配系统 #

你使用的R 4.0.5发布时间早于BigSur正式版，对新系统的兼容性存在缺陷，直接安装适配x86架构macOS的最新版R即可，无需保留旧版本，覆盖安装不会丢失你自己的代码文件。

步骤5：安装编译工具（安装rstan等包前操作） #

rstan、rstanarm属于需要本地编译的包，需要先安装系统编译工具，打开终端执行：

xcode-select --install

按弹出的提示完成安装后，再执行rstan的安装命令即可。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Christian Basile