RStudio点击Knit时渲染根目录index.Rmd而非当前slides目录下Rmd问题

问题原因 #

RStudio检测到项目根目录存在bookdown配置文件_bookdown.yml，因此点击任意Rmd文件的Knit按钮时，会默认调用rmarkdown::render_site()渲染整个bookdown站点，而非当前打开的单个文件，根目录的index.Rmd是bookdown站点的默认渲染入口，所以会出现你观察到的现象。

最优解决方案（一次配置永久生效，无额外操作成本） #

在slides目录下新建一个空的_site.yml文件即可，不需要填写任何内容。

• 原理：rmarkdown渲染时会从当前文件所在目录向上递归查找最近的站点配置文件，_site.yml的优先级高于_bookdown.yml。你在slides目录下添加该文件后，渲染该目录内的Rmd文件时，会将slides识别为当前站点根目录，不会向上查找父目录的bookdown配置，自然就会调用slides/_output.yml渲染当前打开的slide文件。
• 该方案完全不影响根目录bookdown的正常渲染，也不需要修改任何现有文件的内容，一次配置后所有slides文件的Knit按钮都能正常工作。

备选方案（无需新增文件） #

如果不想新增额外配置文件，可以修改RStudio快捷键实现单独渲染：
打开RStudio的Tools -> Modify Keyboard Shortcuts，找到Knit Document（注意不是Knit Site），为其绑定自定义快捷键，需要渲染单个slide时使用该快捷键即可绕过站点渲染逻辑，直接渲染当前文件。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者lillemets