R安装Sleuth包提示rhdf5未导出h5write.default报错如何解决

sleuth包依赖rhdf5包导出的h5write.default对象，但是2.38.0及更高版本的rhdf5已经移除了该对象的导出，官方原版sleuth未做适配，因此触发安装失败。

推荐优先选择适配了新版rhdf5的社区修复版sleuth安装，无需降级依赖：

• 卸载当前已安装的sleuth（如果有残留）

if("sleuth" %in% rownames(installed.packages())) remove.packages("sleuth")

• 安装修复版sleuth

devtools::install_github("omnideconv/sleuth")

如果需要使用官方原版sleuth，可降级rhdf5到兼容版本后再安装：

• 卸载现有rhdf5

remove.packages("rhdf5")

• 安装兼容的2.36.0版本rhdf5

BiocManager::install("rhdf5", version = "3.14")
# 若提示Bioconductor版本不匹配，可先执行`BiocManager::install(version = "3.14")`切换版本后再安装rhdf5

• 安装官方sleuth

devtools::install_github("pachterlab/sleuth")

安装完成后执行library(sleuth)验证，无报错即为安装成功。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Berna de Vries