Python读取空间文件报错Invalid projection: EPSG:4326如何解决

该错误为pyproj依赖的PROJ原生库版本与配套数据库版本不匹配导致：

新版pyproj（v3.0及以上）要求使用PROJ v7.1及以上版本的原生库，旧版PROJ的内置SQLite数据库（proj.db）表结构缺少area_of_use_auth_name等新增字段，执行CRS查询时触发SQL报错。

方案1：conda重装匹配依赖（优先选择） #

conda会自动匹配pyproj与对应PROJ原生库的版本，避免手动安装的版本冲突问题：

• 先卸载当前环境内的相关安装包：

pip uninstall -y pyproj geopandas fiona
conda remove -y pyproj geopandas fiona proj

• 从conda-forge源重新安装整套空间依赖：

conda install -c conda-forge geopandas pyproj

方案2：安装适配旧版PROJ的pyproj版本 #

如果不想升级系统自带的PROJ版本，可根据系统PROJ版本安装对应兼容的pyproj版本：

• 系统PROJ为v6.x：安装pyproj==2.6.1
• 系统PROJ为v5.x：安装pyproj==2.2.2
  安装命令示例：

pip install pyproj==2.6.1

方案3：手动指定PROJ数据库路径 #

如果环境内存在多个PROJ版本导致冲突，可在导入空间库前手动指定pyproj使用正确的数据库路径：

import os
# 替换为当前pyproj安装包附带的proj数据目录
os.environ['PROJ_LIB'] = '/your/python/env/lib/pythonX.X/site-packages/pyproj/proj_dir/share/proj'
import geopandas as gpd

执行以下代码无报错即可确认问题解决：

import pyproj
print(pyproj.CRS("EPSG:4326"))

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Orlando G