在Google Colab运行R内核时如何访问操作系统shell

Colab R内核不支持Python生态的!、%%shell魔法语法，但可以通过R原生的系统调用函数实现同等效果，具体用法如下：

• 方法1：使用system()函数执行单条命令
  该函数是R最基础的系统调用接口，可直接运行传入的shell命令，示例如下：

  # 直接执行命令，输出打印到控制台
  system("ls -la")
  
  # 如需捕获命令输出存入R变量，添加intern = TRUE参数即可
  dir_content <- system("ls -la", intern = TRUE)
  print(dir_content)
  

• 方法2：使用system2()函数（官方更推荐）
  该函数支持参数结构化传递，可避免shell注入风险，更适合带动态参数的调用场景：

  # 无参数调用示例，打印当前工作路径
  system2("pwd")
  
  # 带参数调用示例，查看/content目录下的文件详情
  system2("ls", args = c("-lh", "/content"))
  

• 方法3：执行多行Shell脚本
  如需连续运行多条shell命令，可将命令拼接为字符串传入调用函数即可：

  multi_shell_cmd <- "
  cd /content
  echo '测试内容' > tmp_test.txt
  ls -l tmp_test.txt
  cat tmp_test.txt
  "
  system(multi_shell_cmd)
  

注意：R内核下执行shell命令的默认工作路径与R当前工作路径一致，可通过getwd()查看当前路径、setwd("目标路径")切换路径，无需通过shell的cd命令长期修改工作目录。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Stephen