R markdown knit生成PDF报无限递归错误 空文件失败是否需重装R

Error: evaluation nested too deeply: infinite recursion / options(expressions=)?
Execution halted

该报错无需优先重装R，可按以下顺序排查配置问题：

1. 禁用R启动配置文件测试 #

• 空Rmd文件也触发报错，首先怀疑用户目录下的.Rprofile或.Renviron配置文件存在递归调用逻辑，或是启动时自动加载的包存在冲突
• 临时禁用配置启动R：
  • Windows：启动R时按住Ctrl键，在弹出的提示中选择恢复到默认初始环境
  • macOS/Linux：终端执行R --no-init-file启动
• 启动后打开空Rmd文件执行knit操作，如果可以正常生成PDF，即可定位是配置文件问题，逐行注释.Rprofile内的自定义内容排查冲突项即可，无需重装R

2. 重装核心依赖包 #

• 禁用配置后仍然报错，先重装knit相关的核心包：

remove.packages(c("evaluate", "knitr", "rmarkdown"))
install.packages(c("evaluate", "knitr", "rmarkdown"))

• 执行完成后重启R，再次尝试knit

3. 重置expressions参数 #

• 执行getOption("expressions")查看当前参数值，R默认值为5000，如果你之前手动调小过该参数，会触发递归深度不足报错，执行options(expressions = 5000)恢复默认值后重试

4. 重装R及RStudio #

• 以上步骤全部验证失败后，再选择完全卸载R、RStudio，卸载时删除用户目录下所有R相关的配置文件夹，再重新安装官方最新版本

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Choi Jae-hyoung