Arm架构Mac Monterey系统下R studio出现rJava加载错误如何解决

报错详情 #

Loading required namespace: rJava Failed with error: ‘.onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details: call: dyn.load(jli, FALSE) error: unable to load shared object '/Library/Internet Plug-Ins/JavaAppletPlugin.plugin/Contents/Home/lib/jli/libjli.dylib': dlopen(/Library/Internet Plug-Ins/JavaAppletPlugin.plugin/Contents/Home/lib/jli/libjli.dylib, 0x000A): tried: '/Library/Internet Plug-Ins/JavaAppletPlugin.plugin/Contents/Home/lib/jli/libjli.dylib' (mach-o file, but is an incompatible architecture (have 'x86_64', need 'arm64e')), '/usr/lib/libjli.dylib' (no such file)’ Cannot load rJava Error in .local(x, p, ...) : maxent() is not TRUE

根因说明 #

当前系统安装的Java为x86_64架构版本，与Arm架构Mac的运行环境不兼容，导致rJava包无法正常加载，进而触发依赖rJava的maxent相关功能报错。

解决步骤 #

• 第一步：卸载现有x86架构Java环境
  打开终端执行以下命令删除现有x86架构的Java插件：
  sudo rm -rf /Library/Internet\ Plug-Ins/JavaAppletPlugin.plugin
  同时进入/Library/Java/JavaVirtualMachines/目录，删除目录下所有x86版本的JDK文件夹。
• 第二步：安装Arm架构适配的JDK
  下载安装支持aarch64/arm64架构的JDK版本，安装完成后在终端执行java -version，确认返回信息中包含aarch64/arm64标识则安装正确。
• 第三步：刷新R的Java配置
  终端执行如下命令，让R重新识别系统的Java路径：
  sudo R CMD javareconf
  执行完成后查看输出信息，确认JAVA_HOME路径指向刚安装的Arm版JDK。
• 第四步：源码编译安装rJava包
  打开R studio，在控制台执行以下命令从源码编译安装rJava，避免直接安装二进制版本出现架构不兼容问题：
  install.packages("rJava", type = "source")
  安装完成后执行library(rJava)，无报错则代表rJava加载正常。
• 第五步：验证maxent功能
  重新加载你使用的依赖maxent的相关R包，运行之前触发报错的代码，确认maxent() is not TRUE报错消失。

异常排查 #

如果执行完上述步骤后仍然提示找不到Java路径，可以在运行代码前手动在R中指定JAVA_HOME路径：

# 替换下方路径为你实际安装的Arm版JDK的Home路径
Sys.setenv(JAVA_HOME = "/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk-xxx.jdk/Contents/Home")

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Cristiano De servi