线性对数ggplot中如何让Pearson相关系数不受对数刻度影响正常计算
解决方案
ggpubr::stat_cor()默认会继承全局图层的映射,使用坐标轴转换后的值计算相关系数,因此添加对数刻度后会得到不符合预期的结果。你可以通过为stat_cor()单独指定原始变量映射、关闭全局映射继承的方式实现需求。
修改后的可运行代码如下:
library(tidyverse) library(ggpubr) df <- tibble(A = c(1:10), B = c(1:10)) ggplot(data = df, aes(x = A, y = B)) + geom_point() + # 单独指定原始变量映射,关闭全局继承,使用原始值计算相关系数 stat_cor(aes(x = A, y = B, label = ..r.label..), method = "pearson", inherit.aes = FALSE) + scale_x_continuous(trans = "log10")
运行上述代码后,x轴会保留对数刻度展示,同时stat_cor()计算得到的Pearson相关系数为预期的R=1。该方法不需要提前单独计算相关系数,完全在绘图环节完成逻辑,适配批量探索的需求。
内容的提问来源于stack exchange,提问作者jsgraydon
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