使用PGI编译器安装zlib为部署NetCDF准备环境时configure报错如何解决

1. PGI编译器版本兼容性问题：2020年之前发布的老版PGI编译器对GNU C扩展语法的支持存在缺陷，而你使用的系统glibc版本高于2.28，新版glibc在stdio.h中给__malloc__属性新增了释放函数关联参数，老版pgcc无法识别这种带参数的属性定义，直接触发头文件解析错误。
2. 编译参数错误：你在configure命令中添加的--archs="x86_64"是zlib专为macOS系统设计的参数，Linux环境下使用会导致x86_64被当做无效输入文件传入编译命令，进一步干扰configure的基础类型检测流程，才会出现找不到size_t的报错。

方案1：添加预定义参数兼容属性语法（推荐，无需更换软件版本） #

执行configure时添加预定义宏覆盖系统头文件的属性定义，同时删除无效的--archs参数，命令修改为：

CC=pgcc CFLAGS="-D__attribute_malloc__=__attribute__((__malloc__))" ./configure --prefix=你要安装zlib的路径

如果还有其他属性相关报错，可以追加参数禁用所有GNU属性检测：

CC=pgcc CFLAGS="-D__attribute__(x)= -D__attribute_malloc__=__attribute__((__malloc__))" ./configure --prefix=你要安装zlib的路径

configure执行完成后，正常运行make && make install即可完成zlib安装。

方案2：升级编译器版本 #

将PGI编译器升级为NVHPC 21.7及以上版本（PGI被NVIDIA收购后改名为NVHPC），新版编译器已完整兼容新版glibc的属性语法，直接执行标准configure命令即可完成编译。

方案3：编译静态库规避问题 #

如果不需要使用动态zlib库，可以在configure时添加--static参数强制编译静态库，也可绕过部分头文件检测错误：

CC=pgcc ./configure --static --prefix=你要安装zlib的路径

内容的提问来源于stack exchange，提问作者crargc