conda pack打包时未保留对包的monkey patch修改是什么原因？

核心原因 #

conda pack 默认采用归档优先的打包逻辑：

• 它会先查询环境中每个文件所属的conda包，优先从全局conda包缓存（默认路径为/opt/conda/pkgs/）中拉取对应包的原始文件打包，不会主动读取环境目录下被修改过的文件，目的是提升打包速度、支持跨包文件去重。
• 手动执行时可以正常打包补丁文件的原因：手动操作时大概率你之前执行过清理命令清空了包缓存，conda pack找不到对应包的缓存文件，就会自动降级为直接遍历读取环境目录下的实际文件，所以修改后的内容会被包含。而CI容器环境是全新干净的，安装依赖后包缓存完好，因此conda pack直接调用缓存中的原始文件，忽略了你在/opt/conda/envs/venv/下的修改。

解决方案 #

直接在conda pack命令中添加--no-archive参数即可，该参数会强制conda pack跳过包缓存，直接读取环境目录下的所有实际文件进行打包：

conda pack --name venv --no-archive --output "$BUILD_DIR/runtime.tar.gz"

替代方案（可选） #

如果你不想牺牲归档模式的打包速度，也可以在打完补丁后，将修改后的文件同步覆盖到包缓存中对应Python包的相同路径，再执行打包：

# 找到python 3.7对应的包缓存目录
PY_PKG_DIR=$(ls -d /opt/conda/pkgs/python-3.7.*)
# 覆盖缓存中的对应文件
cp /opt/conda/envs/venv/lib/python3.7/ctypes/__init__.py ${PY_PKG_DIR}/lib/python3.7/ctypes/__init__.py
# 再执行正常打包
conda pack --name venv --output "$BUILD_DIR/runtime.tar.gz"

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Zhao Li