如何使用fftw_malloc分配3D数组用于FFTW多线程3D DFT计算
改造方法
你不需要做3D数组降维映射,FFTW要求的输入是连续行优先存储的数组,fftw_malloc只是对分配的内存做了SIMD对齐优化,内存布局和你原来用new分配的3D数组完全一致,直接按以下步骤改造即可:
1. 3D数组分配改造
直接用fftw_malloc分配对应大小的连续内存,强转为你原来用的三维数组指针即可,原有数组访问逻辑V[i][j][k]不需要做任何修改:
const unsigned int RES = 256; // 分配对齐的连续内存,强转为三维数组指针 std::complex<double>(*V)[RES][RES] = reinterpret_cast<std::complex<double>(*)[RES][RES]>( fftw_malloc(sizeof(std::complex<double>) * RES * RES * RES) );
FFTW官方保证std::complex<double>和fftw_complex的内存布局完全兼容,这个类型转换是安全的。
2. Plan创建流程
这部分和你原有逻辑几乎一致,不需要额外修改:
int N_Threads = omp_get_max_threads(); fftw_init_threads(); fftw_plan_with_nthreads(N_Threads); fftw_complex *input_V = reinterpret_cast<fftw_complex*>(V); fftw_plan FORWARD_V = fftw_plan_dft_3d(RES, RES, RES, input_V, input_V, FFTW_FORWARD, FFTW_MEASURE); fftw_plan BACKWARD_V = fftw_plan_dft_3d(RES, RES, RES, input_V, input_V, FFTW_BACKWARD, FFTW_MEASURE);
3. 资源释放注意事项
需要注意资源释放顺序不能乱,且不能用delete释放fftw_malloc分配的内存:
// 先销毁plan,再释放数组内存 fftw_destroy_plan(FORWARD_V); fftw_destroy_plan(BACKWARD_V); fftw_free(V); // 程序退出前可选调用线程清理接口 fftw_cleanup_threads();
内容的提问来源于stack exchange,提问作者Azure27
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