为什么包含renv的R包在CircleCI中构建失败并提示devtools缺失？

• renv在项目中激活后，默认会启用包隔离机制，仅读取项目renv/library路径下的R包，不会加载镜像中全局安装的系统包
• 你的自定义镜像将devtools安装在R的全局系统库中，renv激活后包搜索路径默认不包含全局库路径，因此调用devtools::install_deps时会触发找不到包的错误
• 无renv配置时R会默认读取全局系统库，因此运行流程正常。

你可以根据自己的使用场景选择以下任意一种方案：

方案1：临时禁用renv激活，使用全局devtools安装依赖 #

适合不需要在CI的依赖安装步骤使用renv环境的场景，仅需修改CI配置中依赖安装的命令，临时关闭renv自动激活即可：

version: 2
jobs:
  build:
    docker:
      - image: my_random_image
    steps:
      - checkout
      - run:
          name: Install package dependencies
          command: R -e "Sys.setenv(RENV_ACTIVATE_PROJECT = FALSE); devtools::install_deps(dep = TRUE)"
      - run:
          name: Build package
          command: R CMD build .
      - run:
          name: Check package
          command: R CMD check *tar.gz

方案2：将devtools加入项目renv依赖 #

适合需要在CI全流程使用renv环境的场景，在本地开发环境的项目目录下执行以下命令，将devtools加入renv锁文件后提交代码即可：

renv::install("devtools")
renv::snapshot()

提交更新后的renv.lock文件到仓库后，CI流程中renv激活后就可以直接读取到项目库中的devtools。

方案3：调整renv配置允许访问全局系统库 #

不需要修改锁文件，仅需在依赖安装步骤前添加renv配置项，允许renv搜索全局系统库即可：

options(renv.config.system.library = TRUE)
devtools::install_deps(dep = TRUE)

对应修改后的CI命令为：

command: R -e "options(renv.config.system.library = TRUE); devtools::install_deps(dep = TRUE)"

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Jacky