如何在Anaconda环境的Jupyter Notebook中安装Rdkit库

推荐优先使用conda命令安装，稳定性最高，操作步骤如下：

步骤1：打开终端并激活目标环境 #

• Windows用户打开「Anaconda Prompt」，Mac/Linux用户直接打开系统终端
• 查看当前所有conda环境，确认你常用的Jupyter所属环境名称：
  conda env list
• 激活对应环境，将下方<env名称>替换为你实际的环境名，使用base环境直接替换为base即可：
  conda activate <env名称>

步骤2：执行Rdkit安装命令 #

优先使用conda-forge源安装，兼容性更好，执行以下命令后根据提示输入y确认安装即可：
conda install -c conda-forge rdkit

步骤3：验证安装是否成功 #

• 在当前环境下启动Jupyter Notebook：
  jupyter notebook
• 新建Notebook文件，执行导入代码验证：

import rdkit
print(rdkit.__version__)

如果正常输出版本号即代表安装成功。

快捷方法：Jupyter内直接安装 #

如果不想退出当前打开的Jupyter Notebook，也可以直接在Notebook单元格内执行安装：

• 新建代码单元格，执行安装命令：
  !conda install -c conda-forge rdkit -y
• 安装完成后点击顶部菜单栏「内核」-「重启内核」，再执行导入代码验证即可。

注意：不推荐使用pip安装Rdkit，尤其是Windows环境下pip版本容易出现依赖缺失、运行报错的问题，conda安装的兼容性和稳定性更高。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Urvesh