Linux下使用Singularity替代docker-compose运行AWSM镜像的方案咨询

• 首先确认你执行singularity pull后，当前目录已生成awsm_0.10.sif镜像文件
• 找到awsm_docker脚本中所有调用docker-compose的代码段，替换为Singularity执行逻辑，示例替换如下：

run_call = ('singularity exec'
            ' --bind ./{}/:/data/input'
            ' awsm_0.10.sif'
            ' /data/input/{}').format(fpc, cfg)
call(run_call, shell=True, universal_newlines=True)

• 脚本中如果存在其他docker-compose stop/rm类的清理命令，直接删除即可，Singularity任务运行结束后会自动释放资源，无需额外清理
• 保存修改后的脚本，重新执行测试命令即可：

python ./awsm_docker --case tuol

说明：你之前遇到的maxus.nc文件不存在报错是因为docker-compose命令执行失败，容器没有正常运行生成对应文件，替换为Singularity命令后容器正常运行即可生成所需文件，后续报错会同步消失。如果运行过程中出现路径找不到的问题，可按需在--bind参数后追加挂载规则，多个挂载规则用英文逗号分隔即可。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者agentrrb