ggplot2如何仅为指定分组线条添加geom_ribbon置信区间

你的报错是因为全局映射里的color=peaks会自动将peaks作为分组变量，geom_ribbon默认会给所有分组生成图层，eprint_peaks分组的上下界全为NA，计算范围时没有有效值就触发了警告，同时导致绘图异常，两种解决方法如下：

解决方案1：单独为置信区间图层指定数据源（更推荐） #

直接给geom_ribbon筛选仅包含mean_random_peaks分组的数据，完全避开处理全NA的分组，逻辑清晰不易出问题：

ggplot(data=dat,aes(x=overlaps,y=log(N),color=peaks)) + 
  geom_line()+
  geom_ribbon(data = ~subset(.x, peaks == "mean_random_peaks"),
              aes(ymin=lower_boundary, ymax=upper_boundary, fill = peaks),
              alpha = 0.2, # 调整透明度避免遮挡折线
              color = NA) # 去掉置信区间的边框，避免和折线颜色重复

解决方案2：增加na.rm参数忽略NA值 #

如果不想筛选数据，直接在geom_ribbon中加na.rm=TRUE参数，会自动忽略全NA的分组，也可以消除警告：

ggplot(data=dat,aes(x=overlaps,y=log(N),color=peaks)) + 
  geom_line()+
  geom_ribbon(aes(ymin=lower_boundary, ymax=upper_boundary, fill=peaks),
              alpha=0.2, 
              color=NA, 
              na.rm = TRUE)

内容的提问来源于stack exchange，提问作者moth