R语言readLines读取路径报无法打开连接、权限被拒错误如何解决
报错根因
- 路径传入错误:
list.files()默认会返回目标目录下所有子项路径,同时包含普通文件和子文件夹。你报错路径对应的002是子文件夹而非文本文件,readLines()仅支持读取文本类文件,传入文件夹路径时,Windows系统不允许以文本流方式打开文件夹对象,就会抛出"Permission denied"提示,和实际访问权限、杀毒软件、工作目录配置无关。 - 函数认知偏差:
- 单独测试
readLines读取txt正常,是因为传入了符合要求的文本文件路径 - 替换为
readline后无报错,是因为readline是交互式输入函数,仅会把传入的路径字符串作为控制台提示语打印,根本不会读取路径对应的本地文件,和文件读取逻辑完全无关 - 手动用
paste0拼接子文件路径能临时运行,本质是把传入readLines的参数从「子文件夹路径」改成了「具体文本文件路径」,刚好符合函数入参要求
- 单独测试
- 隐含笔误:原代码定义长度变量时写的是大写开头的
Ids_no,循环调用时写的是小写开头的ids_no,R对大小写敏感,这个笔误也会触发对象不存在的报错。
可行解决方案
方案1:直接读取当前目录下的所有文本文件
遍历前先过滤掉子文件夹,仅保留可读取的普通文件,不需要手动拼接路径:
setwd("C:/Users/JJ/Desktop/features") file_directory <- "C:/Users/JJ/Desktop/features" # 获取目录下所有子项路径 all_items <- list.files(file_directory, full.names = TRUE) # 过滤掉子目录,仅保留普通文件 file_paths <- all_items[!file.info(all_items)$isdir] # 如果仅需要读取txt格式文件,可直接用规则过滤 # file_paths <- list.files(file_directory, full.names = TRUE, pattern = "\\.txt$") ids_no <- length(file_paths) data_list <- list() for (i in 1:ids_no){ data_list[[i]] <- readLines(file_paths[i]) }
方案2:读取所有子文件夹下的固定命名文件
如果你的需求是遍历每个子文件夹,读取其中的feature.txt文件,可以用路径处理函数优化手动拼接的逻辑,避免斜杠书写错误:
file_directory <- "C:/Users/JJ/Desktop/features" # 获取当前目录下所有一级子文件夹路径 sub_dirs <- list.dirs(file_directory, full.names = TRUE, recursive = FALSE) # 自动拼接目标文件路径,过滤掉不存在的无效路径 target_files <- file.path(sub_dirs, "feature.txt") target_files <- target_files[file.exists(target_files)] # 批量读取文件,lapply会直接返回和文件顺序对应的列表 all_feature_data <- lapply(target_files, readLines)
注:
file.path()会自动适配不同操作系统的路径分隔符,比手动用paste0拼接路径的兼容性更好。
内容的提问来源于stack exchange,提问作者zeno Zeng
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