matplotlib绘制散点子图报错x and y must be the same size

你遇到的x and y must be the same size报错，在读取shapefile得到的GeoDataFrame场景下，绝大多数情况不是字段总长度不一致，是空值、字段维度、索引异常导致的隐式长度不匹配，按以下顺序排查即可：

• 优先排查空值错位问题
  你之前校验长度时大概率只看了整个表的行数，没有统计字段内的实际有效值数量。如果pop、log_lights1992、log_lights2013三个字段的空值位置不重合，单独取列时matplotlib不会自动对齐空值，就会出现长度不匹配。
  先把绘图用到的字段单独取出做整行去空，再用处理后的数据绘图：

  # 提取需要的列，整行删除存在空值的记录
  plot_data = city_join[["pop", "log_lights1992", "log_lights2013"]].dropna()
  f, ax = plt.subplots(1, 2, figsize=(20, 10))
  ax[0].scatter(plot_data["pop"], plot_data["log_lights1992"])
  ax[1].scatter(plot_data["pop"], plot_data["log_lights2013"])
  

  如果需要定位具体是哪个字段存在空值，可以执行print(city_join[["pop", "log_lights1992", "log_lights2013"]].isna().sum())打印每个字段的空值数量。
• 排查字段维度异常
  部分shapefile读取时会把数值型字段存为嵌套的二维结构（比如每个单元格是长度为1的列表），这种情况下即使行数一致，传入scatter的参数实际维度不匹配也会报错。执行以下代码检查字段维度：

  print(city_join["pop"].ndim, city_join["log_lights1992"].ndim, city_join["log_lights2013"].ndim)
  

  正常一维字段返回值为1，如果返回值为2，对字段值做展平处理即可：city_join["pop"].values.flatten()
• 排查索引不连续问题
  如果之前对city_join做过空间连接、条件筛选、空间裁剪等操作，DataFrame可能保留原有索引导致索引不连续，取列运算时会触发pandas的隐式对齐，出现长度异常。绘图前先重置索引即可：

  city_join = city_join.reset_index(drop=True)
  

注意：不要直接对x、y两个序列分别单独做dropna()，两个字段空值位置不重合时，单独去空后两个序列的长度依然会不一致，必须对用到的所有字段整行去空。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者OgeiD