R语言ggplot2如何按分组为箱线图geom_jitter点设置颜色

你的代码存在两个核心错误：

• color = Trial 写在了 ggplot() 的aes()映射函数外部，不会被识别为基于数据列的视觉映射，仅会被当做无效的全局参数，无法实现按Trial分组给点着色的效果。
• 若直接把color = Trial写在全局aes()中，会导致箱线图也按照Trial字段分组，每个浓度梯度下会生成多个对应不同Trial的细碎箱线，不符合“每个浓度一个汇总箱线图，仅叠加的抖动点按Trial区分颜色”的需求。

library(tidyverse)

plot_dat %>% 
  ggplot(aes(x = conc, y = score)) + 
  geom_boxplot(outlier.shape = NA, width = 0.6) +
  geom_jitter(aes(color = Trial), width = 0.1, size = 2, alpha = 0.8) +
  theme_bw() + 
  xlab("") + 
  ylab("Qubit Read (ng/uL)")

• 原代码中geom_jitter()的width = 0.01数值过小，抖动后的点几乎完全重叠在竖线上，示例中调整为0.1，你可以根据最终展示效果自行修改宽度值。
• 示例给抖动点增加了alpha = 0.8透明度参数，避免点完全重叠时无法识别点的数量，不需要可直接删除。
• 给geom_boxplot()增加了width = 0.6参数调整箱线宽度，和抖动点的排布更协调，可按需调整。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者littleworth