我之前碰到过几乎一样的问题，这种链接错误大概率是ABI兼容性不匹配或者CMake链接配置/顺序有误导致的，下面是分步解决方案：

1. 先确认ABI兼容性（最常见触发原因） #

Ubuntu 18.04默认的GCC使用的是旧版CXX ABI（_GLIBCXX_USE_CXX11_ABI=0），而你下载的LibTorch如果是基于新版CXX ABI编译的，就会和系统APT安装的HDF5（用旧ABI编译）出现符号不兼容，进而触发未定义引用错误。

检查LibTorch的ABI版本： #

打开third_party/libtorch/include/torch/csrc/api/include/torch/types.h，查找以下定义：

#define _GLIBCXX_USE_CXX11_ABI 0 // 旧ABI，与Ubuntu18.04默认兼容
// 或者
#define _GLIBCXX_USE_CXX11_ABI 1 // 新ABI，需要手动调整项目ABI

如果LibTorch是新ABI（值为1），在你的CMakeLists.txt中添加以下代码，强制项目使用新ABI：

add_definitions(-D_GLIBCXX_USE_CXX11_ABI=1)

如果是旧ABI，这一步可以直接跳过。

2. 完善CMakeLists.txt的HDF5链接配置 #

你的原有配置可能没有完全链接HDF5的C++组件（包括HL库），同时GCC对链接顺序敏感，依赖库需要放在被依赖库之后，调整后的CMakeLists.txt如下：

project(cpptorch)
# 统一ABI（根据上面的检查结果选择添加）
# add_definitions(-D_GLIBCXX_USE_CXX11_ABI=0) 或者 1

set(CMAKE_CXX_STANDARD 14)
set(CMAKE_CXX_STANDARD_REQUIRED ON)

# 指定LibTorch路径，避免CMake找不到
set(CMAKE_PREFIX_PATH "${PROJECT_SOURCE_DIR}/third_party/libtorch")
find_package(Torch REQUIRED)

# 查找HDF5的所有必要组件：C、C++、HL
find_package(HDF5 REQUIRED COMPONENTS C CXX HL)
include_directories(${HDF5_INCLUDE_DIRS})

# 收集所有HDF5相关库，确保C++和HL组件都被包含
set(HDF5_FULL_LIBS 
    ${HDF5_CXX_LIBRARIES} 
    ${HDF5_HL_CXX_LIBRARIES} 
    ${HDF5_LIBRARIES} 
    ${HDF5_HL_LIBRARIES}
)

add_executable(cpptorch main.cpp)

# 调整链接顺序：先链接HDF5，再链接LibTorch（确保依赖关系正确）
target_link_libraries(cpptorch PRIVATE ${HDF5_FULL_LIBS} ${TORCH_LIBRARIES})

# 确保编译标准与LibTorch完全一致
target_compile_features(cpptorch PRIVATE cxx_std_14)

3. 清理缓存并重新编译 #

旧的build目录可能残留了错误的配置缓存，先删除build文件夹，再重新运行脚本：

rm -rf build
./run.sh

额外验证步骤 #

如果问题仍然存在，先确认系统已安装HDF5的C++库：

dpkg -l | grep libhdf5-cpp

如果没有输出，执行以下命令安装：

sudo apt-get install libhdf5-cpp-100

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Iks