Java开发DNA基因查找程序时for循环停在dna[2]无输出问题咨询

程序不是卡在dna[2]的遍历步骤，是执行到后续元素时触发了字符串下标越界异常，导致程序直接终止运行，看起来像是卡住无输出。

错误根因 #

findSimpleGene方法的逻辑顺序写错了：

• 你在还没校验startIndex（起始密码子atg的位置）、stopIndex（终止密码子taa的位置）是否合法的情况下，就提前执行了substring截取操作
• 当DNA串里找不到atg、或者atg后面找不到taa时，indexOf会返回-1，这时候把-1传入substring当坐标，或者传入的结束坐标小于起始坐标，就会直接抛出StringIndexOutOfBoundsException中断程序
• 你观察到的"到dna[2]就停"，实际是dna[2]的结果正常输出后，处理dna[3]时触发了异常：dna[3]里atg后面没有taa，stopIndex返回-1，执行截取时直接崩溃。

修复后代码 #

只需要调整findSimpleGene的逻辑顺序，把截取操作放到所有合法性校验通过之后即可：

public String findSimpleGene (String dna) {
    int startIndex = dna.indexOf("atg");
    // 没找到起始密码子直接返回
    if (startIndex == -1) {
        return "Not Exist";
    }
    int stopIndex = dna.indexOf("taa", startIndex+3);
    // 没找到符合位置要求的终止密码子直接返回
    if (stopIndex == -1) {
        return "Not Exist";
    }
    // 校验基因长度是否是3的倍数
    if ((stopIndex - startIndex) % 3 == 0) {
        return dna.substring(startIndex, stopIndex+3);
    }
    return "Not Exist";
}

替换原方法后再执行testSimpleGene，就能正常遍历输出所有5个测试用例的结果，不会中途中断。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者RaymondGuo001