ggplot2绘制双折线图如何指定x轴顺序并解决连线异常问题

group=1的设置是错的，这个参数会把所有数据点强制归为同一个分组，所以折线会跨valence类别把所有点连在一起，当然出不来两条独立的线。
之前报geom_path: Each group consists of only one observation，是因为你把x轴转成因子后，ggplot默认的分组逻辑没识别到应该按valence拆分组，解决方法是明确指定正确的分组变量，不是把所有数据塞到一个组里。

• 原来给run设置因子水平的代码是对的，留着就行，能保证x轴顺序是你要的
• 把ggplot映射里的group=1改成group=valence，明确告诉ggplot按valence字段拆分折线
• 给点、线、误差棒加统一宽度的位置避让，不然不同组的元素会叠在一起错位

# 自定义x轴顺序，原有逻辑无需修改
stats$run <- factor(stats$run, levels = c("Nobs_mINS","Nnf1_mINS","Nnf2_mINS"))

ggplot(stats,aes(x=run,y=mean,color=valence,group=valence))+ 
    geom_point(position = position_dodge(0.2)) +
    geom_line(position = position_dodge(0.2))+
    geom_errorbar(aes(ymin = mean - sem, ymax = mean + sem),                         
                  width = 0.2,
                  position = position_dodge(0.2))

注意：三个几何层要用相同宽度的position_dodge，不然点、线、误差棒会对不齐，偏移错位。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Sophy