R语言ComplexHeatmap用column_split实现热图X轴4分区

代码未实现4分区的核心错误是column_split参数传值错误：你当前将整个tdfdarkgrey数据集传入该参数，但column_split需要接收与热图列数长度一致、顺序一一对应的分组向量，传入完整数据集会导致函数无法识别你指定的X1分组列，自然无法输出目标4分区效果。

• 第一步：分离绘图数值矩阵与分组向量
  你的tdfdarkgrey中X1是分组列（因子类型，非数值），其余列是用于绘制热图的数值型特征值，需要先拆分两类数据，避免非数值列干扰热图绘制：

  library(ComplexHeatmap)
  # 提取X1列作为分组向量
  split_group <- tdfdarkgrey$X1
  # 可选：固定4个分组的展示顺序，避免自动排序打乱亚型排列
  split_group <- factor(split_group, 
                        levels = c("Proneural", "Neural", "Classical", "Mesenchymal"))
  # 提取纯数值矩阵作为热图输入，剔除分组列X1
  heatmap_mat <- data.matrix(tdfdarkgrey[, colnames(tdfdarkgrey) != "X1"])
  

• 第二步：传入正确参数绘制热图
  将column_split参数替换为单独提取的分组向量即可实现4分区效果，其余你原代码的参数设置（关闭聚类、隐藏标签等）无需调整：

  Heatmap(heatmap_mat, 
          column_split = split_group,
          show_row_names = FALSE, 
          show_row_dend = FALSE, 
          show_column_dend = FALSE, 
          show_column_names = FALSE,
          show_parent_dend_line = FALSE, 
          cluster_rows = FALSE, 
          cluster_columns = FALSE, 
          column_title = NULL, 
          heatmap_legend_param = list(title = "Scale"))
  

• 必须保证分组向量split_group的长度和热图矩阵heatmap_mat的列数完全相等，且向量顺序和矩阵的列顺序一一对应，否则会出现分组错位。
• 保持cluster_columns = FALSE时，同一分组内的样本会按照你原始数据集的列顺序排列聚合；如果需要同组内样本按相似性聚类，可将该参数改为TRUE，不会影响4个大分区的划分。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者driver