如何在flatpak-builder环境中安装Eigen等header-only库

你的配置没生效有两个核心错误：

• install -d参数的作用是创建空目录，根本不会执行文件/文件夹复制操作，运行完只会得到两个空文件夹，自然不会有头文件被安装
• Flatpak构建沙箱有严格的路径规则：所有模块的安装内容必须放到/app前缀下，直接写/include属于沙箱系统路径，要么无写入权限，要么内容不会被纳入打包范围，也不会被后续CMake构建流程的默认搜索路径识别。

另外你判断错了一点：Eigen虽然是纯头文件库，但它原生提供了完整的CMake构建配置，完全没必要用simple构建系统手动拷文件，直接用你熟悉的cmake-ninja是最稳妥的方案，还能自动导出CMake依赖配置，后续应用代码里直接find_package(Eigen3 REQUIRED)就能识别，不用手动加头文件路径。

推荐方案：用cmake-ninja构建（零额外适配） #

直接把你写的eigen模块改成如下配置即可，所有安装逻辑Eigen的CMake脚本会自动处理，还会自动关掉不需要的文档、测试编译步骤，节省构建时间：

{
    "name": "eigen",
    "buildsystem": "cmake-ninja",
    "config-opts": [
        "-DCMAKE_BUILD_TYPE=Release",
        "-DEIGEN_BUILD_DOC=OFF",
        "-DEIGEN_BUILD_TESTS=OFF",
        "-DBUILD_TESTING=OFF"
    ],
    "sources": [
        {
            "type": "archive",
            "url": "https://gitlab.com/libeigen/eigen/-/archive/3.3.9/eigen-3.3.9.zip",
            "sha512": "3b06da583037649ad42190bd018ddf40b85179ad0877ebd7c1ca7b8498a1453eed25919de27d3bb737754086e1513408e7de4a2110d51912f2e5503e1ab7d838"
        }
    ]
}

备选方案：坚持用simple构建系统手动安装 #

如果你一定要用simple构建系统，需要先修正两个细节：

• 源码压缩包解压后会生成eigen-3.3.9的根目录，头文件存放在这个子目录下，要么在模块里加"subdir": "eigen-3.3.9"指定工作目录，要么命令里写全路径
• 目标路径必须是/app/include，复制目录要用递归复制参数，不能用install -d

对应配置如下：

{
    "name": "eigen",
    "buildsystem": "simple",
    "build-commands": [
        "install -d /app/include",
        "cp -r eigen-3.3.9/Eigen /app/include/",
        "cp -r eigen-3.3.9/unsupported /app/include/"
    ] ,
    "sources": [
        {
            "type": "archive",
            "url": "https://gitlab.com/libeigen/eigen/-/archive/3.3.9/eigen-3.3.9.zip",
            "sha512": "3b06da583037649ad42190bd018ddf40b85179ad0877ebd7c1ca7b8498a1453eed25919de27d3bb737754086e1513408e7de4a2110d51912f2e5503e1ab7d838"
        }
    ]
}

• Flatpak构建阶段是完全隔离的沙箱环境，没有apt、dnf这类系统包管理器可用，所有依赖都必须以模块形式写入manifest，从源码构建或者直接拷贝文件，不允许从软件源拉取包安装。不同版本的Freedesktop SDK、GNOME SDK、KDE SDK会自带一批常用基础库，除此之外的依赖都需要自行添加模块构建。
• 之前的命令没有报错，是因为install -d Eigen /include/Eigen的实际执行逻辑是创建两个空目录：一个是当前工作目录下的Eigen空文件夹，另一个是尝试在根目录/include下创建Eigen空文件夹，既没有复制任何头文件，路径也不在CMake默认搜索范围内，自然后续构建找不到依赖。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者codeling