嘿，我来帮你把这两种运行方式的核心差异讲明白，先纠正个小问题：你写的方式1 conda activate my_env python3 my_python_script其实是错误的语法哦，正确的写法应该是分两步执行 conda activate my_env && python3 my_python_script，或者用conda官方推荐的conda run -n my_env python3 my_python_script来模拟激活环境后的执行流程。接下来聊聊哪些场景下两种方式会产生明显差异：

• 额外环境变量的加载差异
  激活conda环境时，除了把环境的~/anaconda3/envs/my_env/bin加入PATH，还会自动执行环境目录下etc/conda/activate.d和etc/conda/deactivate.d里的脚本。这些脚本通常会设置一些特定的环境变量，比如科学计算库的路径、日志级别配置（像TensorFlow的TF_CPP_MIN_LOG_LEVEL）、CUDA相关的环境变量等。而直接调用环境里的python（方式2）只会使用当前shell的原有环境变量，完全不会触发这些激活脚本的配置，如果你脚本依赖这些变量，结果就会不一样。

• shell别名与函数的可用性
  激活环境时，conda可能会给当前shell设置一些专属别名或函数（比如部分conda工具的快捷调用命令）。如果你的Python脚本里用subprocess调用了这些别名/函数，用方式1运行时能正常识别；但方式2直接跑脚本的话，shell上下文没加载这些别名，调用就会报错。

• 环境内可执行工具的调用差异
  要是你的脚本里用subprocess调用了安装在conda环境里的其他可执行文件（比如ffmpeg、git或者其他conda安装的命令行工具），方式1激活环境后，PATH里包含了环境的bin目录，subprocess能直接找到环境内的版本；而方式2下，当前shell的PATH没更新，subprocess会去找系统默认路径里的工具，大概率会用系统版本，甚至找不到工具抛出异常。

• conda包的激活钩子执行
  部分conda包在安装时会添加激活钩子脚本，比如mamba、一些并行计算库，激活环境时这些钩子会调整PYTHONPATH、设置OpenMP线程数等关键配置。直接调用环境python的话，这些钩子完全不会执行，可能导致库的运行行为异常（比如并行计算效率骤降、依赖找不到）。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Camilo