Android构建报错：app-debug.apk已包含classes.dex无法覆写

这个报错和jar包签名差异没有关系——签名是apk打包完成后的后置流程，当前报错出现在apk条目写入阶段，还没到签名环节。
核心触发原因是你导入的myjar.jar不是Android项目可直接依赖的标准格式jar（即纯.class文件按包名结构打包的产物），而是已经经过dex编译处理的文件，大概率是提供方直接把dex文件、甚至把apk改后缀打包成的jar，包内根目录自带了classes.dex文件。Gradle构建时，会同时把项目自身编译生成的classes.dex、jar包内自带的classes.dex写入apk压缩包，同路径条目无法覆盖就会抛出该错误。
清理build目录、升级Gradle版本仅能解决缓存损坏、旧版Gradle逻辑bug导致的偶发重复问题，对这类依赖本身格式错误的场景完全无效，不用在这两个操作上浪费时间。

• 先确认问题：将app/libs/myjar.jar后缀改为.zip直接解压，查看压缩包根目录，如果能直接看到classes.dex文件，即可确认是上述原因。
• 优先方案：联系jar包提供方，索要未经过dex处理的原始SDK jar包（标准依赖jar解压后是按包名层级存放的.class文件，不存在dex文件），替换libs目录下的问题jar后重新同步构建即可。
• 无原始包的应急方案：手动将现有jar内的dex还原为标准class结构后再引入：
  1. 解压问题jar，提取出根目录下的classes.dex文件
  2. 找到你Android SDK安装路径下build-tools/<你当前用的构建版本号>/目录内的dex2jar工具，执行转换命令：

     # Windows环境执行bat脚本
     d2j-dex2jar.bat classes.dex -o myjar_fixed.jar
     
     # Mac/Linux环境执行sh脚本
     sh d2j-dex2jar.sh classes.dex -o myjar_fixed.jar
     

  3. 将生成的myjar_fixed.jar放入app/libs目录，替换原有问题jar，重新执行构建即可。
• 避坑提醒：不要将apk、aab格式的安装包文件改后缀后作为jar依赖导入，这类产物本身已经包含编译完成的dex文件，必然触发同类重复条目报错。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Bajrang Hudda