awk交换字段时第三字段仅打印首个单词的原因及解决方法

• awk 默认输入字段分隔符FS是任意连续空白（空格、制表符都算分隔标记），你只设置了输出分隔符OFS为制表符，没指定输入分隔规则，导致第三列里的空格被当成了字段分割点，原本一整列的mitochondrial genome maintenance被拆成了三个独立字段：$3只存了第一个词mitochondrial，后面的genome和maintenance分别存在$4、$5里，你只打印$3当然拿不到完整内容。

处理制表符分隔文件时，必须同时指定输入、输出分隔符为制表符，让awk严格按制表符切分字段，字段内部的空格会被当做普通文本保留，不会被拆分：

awk 'BEGIN{FS=OFS="\t"}{print $2,$1,$3}' file.txt

执行后输出完全符合预期：

Akt3    GO:0000002  mitochondrial genome maintenance
Mef2a   GO:0000002  mitochondrial genome maintenance
Mgme1   GO:0000002  mitochondrial genome maintenance
Mpv17   GO:0000002  mitochondrial genome maintenance
Mrpl15  GO:0000002  mitochondrial genome maintenance

如果你的文件后续列数不固定，只是要交换前两列、保留后面所有原始内容，可以用更通用的写法，不需要关心总共有多少字段：

awk 'BEGIN{FS=OFS="\t"}{tmp=$1; $1=$2; $2=tmp; print $0}' file.txt

内容的提问来源于stack exchange，提问作者ForEverNewbie