Python新增范围判断提取原子坐标输出空列表问题排查

你的判断条件存在两处核心问题，直接导致所有行都匹配失败，最终输出空列表：

• 语法写法错误：Python中用于判断元素是否属于某个序列/范围的合法运算符只有in，不存在is in这种组合写法，属于无效语法。
• 数据类型不匹配：从文件读取的内容经split()拆分后，所有元素都是字符串类型，i[5]也不例外；但range(1,288)包含的元素全是整数，字符串和整数的值永远不会相等，就算修正语法问题，判断条件也会始终返回False，无法进入追加坐标的代码分支。
  另外还有一个容易遗漏的区间规则问题：Python的range是左闭右开区间，你写range(1,288)实际覆盖的整数范围是1到287，288本身不在判断范围内。

1. 删除多余的is关键字，使用正确的in运算符做成员判断
2. 做范围判断前，先将i[5]从字符串转换为整数，解决类型不匹配问题
3. 如果需要包含288这个边界值，将range的结束参数设置为289

修正后的判断语句如下：

if i[0]=="ATOM" and i[2]=="CA" and i[4]=="A" and int(i[5]) in range(1, 289):

完整可运行的修正后代码（同步修复了原代码中print语句的缩进问题）：

y = []
with open('insert my top secret super file here') as protein:
    for i in protein:
        i = i.split()
        coords = []
        if i[0] == "ATOM" and i[2] == "CA" and i[4] == "A" and int(i[5]) in range(1, 289):
            coords.append(float(i[6]))
            coords.append(float(i[7]))
            coords.append(float(i[8]))
            y.append(coords)
print(y)

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Judeah Wallace