Win10运行snakemake-minimal7.8.5无法写入元数据故障问询

Windows 10系统中运行snakemake-minimal=7.8.5时出现异常：工作流的规则可正常执行，但Snakemake会因元数据相关错误终止，报错信息如下：

Failed to set marker file for job started ([Errno 2] No such file or directory: 'C:\\test\\project\\.snakemake\\incomplete\\cnVucy9leHBlcmltZW50XzAzL2RmX2ludGVuc2l0aWVzX3Byb3RlaW5Hcm91cHNfbG9uZ18yMDE3XzIwMThfMjAxOV8yMDIwX04wNTAxNV9NMDQ1NDcvUV9FeGFjdGl2ZV9IRl9YX09yYml0cmFwX0V4YWN0aXZlX1Nlcmllc19zbG90XyM2MDcwLzE0X2V4cGVyaW1lbnRfMDNfZGF0YS5pcHluYg=='). Snakemake will work, but cannot ensure that output files are complete in case of a kill signal or power loss. Please ensure write permissions for the directory C:\test\project\.snakemake

已执行的排查操作 #

• 更换项目存放路径：先后尝试将项目放在Documents文件夹、用户个人目录、C盘根目录下，故障依旧
• 调整系统安全设置：检查受控文件夹访问（勒索软件防护）相关配置，确认该功能已关闭

初步排查结论 #

手动删除.snakemake文件夹后，程序运行时可自动重建该目录，可确认当前账号对工作目录具备基础写入权限，推测是系统某项安全配置拦截了带哈希值的长文件名写入操作。
在另一台Windows 10设备上运行完全相同的工作流无此报错，因此判定故障与当前Windows系统的本地配置相关，征集遇到过相同错误的用户分享可行解决方案。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者enryh