rsync使用--ignore-existing参数仍重复复制相同文件原因排查

你当前使用的排查手段存在明确盲区：ls -le仅能展示文件权限、所有者、基础ACL、秒级精度的修改时间，diff仅校验文件正文内容，三类rsync默认校验的元数据维度完全没有覆盖，这些差异都会触发文件复制操作：

• 亚秒级修改时间偏差
  原生APFS/HFS+文件系统的修改时间精度为纳秒级，而USB存储常用的exFAT/FAT32文件系统时间戳精度仅为2秒（FAT32）或10毫秒（exFAT），第三方NTFS挂载工具也常出现时间戳上报偏差。这类偏差普遍小于1秒，ls默认仅展示整秒级时间，肉眼核对完全一致，但rsync会读取纳秒级精度的时间戳，存在偏差即判定文件需要更新。
• 文件系统标志（file flags）差异
  macOS支持通过chflags为文件设置锁定、禁止修改、隐藏等专属标记，这部分信息ls -le不会输出，必须添加-O（大写O）参数才能查看。系统自带的rsync集成了苹果官方补丁，归档模式（-a）下默认校验该属性，只要两边flags不匹配，即使内容、权限、修改时间完全一致，也会触发复制。
• 扩展属性（xattr）与Mac专属元数据差异
  macOS下的文件会附带大量扩展属性，包括下载文件的隔离标记（打开时弹出“来自互联网”提示的依据）、Finder标签/颜色标记、Spotlight注释、旧版资源分支数据等。这类信息完全不会出现在ls -le的输出中，需要通过xattr -l <文件路径>命令查看。苹果定制版rsync默认校验这部分元数据，目标文件缺失对应属性或属性内容不一致时，就会判定文件需要同步。

对应解决方案 #

• 时间戳精度问题：执行stat -x <源文件路径>和stat -x <目标文件路径>，对比Modify time字段的精确值确认偏差。确认后为rsync添加--modify-window=2参数，允许2秒以内的修改时间误差，即可适配低精度文件系统，消除误判。
• 文件flags差异：执行ls -lO <源文件路径>和ls -lO <目标文件路径>对比flags列，不需要同步flags时为rsync添加--no-flags参数跳过校验即可。
• 扩展属性差异：执行xattr -l <源文件路径>和xattr -l <目标文件路径>对比属性列表，不需要同步xattr时为rsync添加--no-xattrs参数跳过校验；需要同步扩展属性时，确认rsync添加了--xattrs参数（Homebrew安装的第三方rsync默认不开启该参数）。
• 第三方NTFS驱动导致的元数据上报异常：可临时添加--size-only参数，仅通过文件大小判定是否需要同步，规避驱动上报不准的问题。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Tom S