如何使用terra包堆叠/拼接列表中的SpatRaster栅格
terra包列表栅格堆叠拼接实现方案
报错原因
terra包中用于拼接多层栅格的c()方法,仅接受独立的SpatRaster对象或栅格文件路径作为入参,不支持直接传入存储SpatRaster的列表对象,因此直接运行c(r_list)会抛出参数类型错误。
实现方法
方法1:do.call传参(最推荐)
利用R基础函数do.call(),可以将列表中的元素自动拆解为独立参数传入目标函数,完全等效于raster包中stack()直接传列表的效果,代码如下:
library(terra) # 测试数据构造 r1 <- rast(nrows = 1, ncols = 1, resolution = 0.5, xmin = -1.5, xmax = 1.5, ymin = -1.5, ymax = 1.5, vals = 0.1) r2 <- rast(nrows = 1, ncols = 1, resolution = 0.5, xmin = -1.5, xmax = 1.5, ymin = -1.5, ymax = 1.5, vals = 0.2) r_list <- list(r1, r2) # 核心拼接代码 r_stack <- do.call(c, r_list)
运行后得到的多层SpatRaster对象输出如下,和raster包生成的RasterStack结构完全对应:
class : SpatRaster dimensions : 6, 6, 2 (nrow, ncol, nlyr) resolution : 0.5, 0.5 (x, y) extent : -1.5, 1.5, -1.5, 1.5 (xmin, xmax, ymin, ymax) coord. ref. : lon/lat WGS 84 sources : memory memory names : lyr.1, lyr.2 min values : 0.1, 0.2 max values : 0.1, 0.2
方法2:Reduce迭代拼接
如果偏好函数式编程写法,也可以用Reduce()将c()方法逐次应用在列表的所有栅格对象上,实现相同的拼接效果:
r_stack <- Reduce(c, r_list)
注意事项
- 待拼接的所有栅格必须保持一致的坐标参考系、空间分辨率和空间范围,否则会触发拼接错误或自动触发不必要的重采样,该要求和raster包
stack()函数完全一致。 - 如果列表中同时包含SpatRaster对象和本地栅格文件路径字符串,上述两种方法都可以自动识别并读取路径对应的栅格完成拼接。
内容的提问来源于stack exchange,提问作者Javier Fajardo
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