R jsonlite包data.frame转JSON时字段名in被自动加句点问题

字段名被修改和jsonlite包没有关系，是R创建data.frame的默认机制导致的：

• in是R的内置保留关键字，属于语法层面被占用的名称
• data.frame()默认开启check.names = TRUE校验，会自动将不符合R变量命名规则、与保留字重名的列名做合规化修正，你定义的"in"列在data.frame创建阶段就已经被自动重命名为"in."，toJSON()只是如实输出已经存在的列名而已。

创建data.frame时传入check.names = FALSE参数，关闭自动列名校验修正即可。

修正后的完整代码：

library(jsonlite)

query_json3 <- data.frame(
  "eClass" = c("Fermentation","Sample", "ResultValue","Experiment"), 
  "collection" = c("fermentations","samples", "resultValues", "experiments"),
  check.names = FALSE
)
filters1 <- data.frame(
  "field" = "attributes.experiment", 
  "value" = "EXP-EB-22-019",
  check.names = FALSE
)
filters2 <- data.frame(
  "field" = "originID", 
  "in" = "fermentations.originID",
  check.names = FALSE
)
filters3 <- data.frame(
  "field" = "SubjectID", 
  "in" = "samples.id",
  check.names = FALSE
)
filters4 <- data.frame(
  "field" = "type", 
  "value" = "Small-Scale Screening",
  check.names = FALSE
)

query_json3[1, "filters"][[1]] <- list(filters1)
query_json3[2, "filters"][[1]] <- list(filters2)
query_json3[3, "filters"][[1]] <- list(filters3)
query_json3[4, "filters"][[1]] <- list(filters4)

toJSON(query_json3)

运行上述代码输出的JSON会保留"in"字段名，和预期输出完全一致。

如果是已经生成好的data.frame，也可以在转JSON前手动修正列名：

# 把所有被改成in.的列名改回in
colnames(filters2)[colnames(filters2) == "in."] <- "in"
colnames(filters3)[colnames(filters3) == "in."] <- "in"

内容的提问来源于stack exchange，提问作者DavidLH