升级Conda至4.13.0及Python至3.9时遭遇依赖冲突问题咨询

我的Conda长期未更新，初始版本为4.1左右，配套Python 3.5.2。计划升级至Python 3.9，先后执行了以下命令：

conda update conda
conda update anaconda
conda update python
conda update -all

虽有进展，但最终Conda停留在4.5.11版本、Python停留在3.5.6版本无法继续升级。执行conda update conda或conda update -n base -c defaults conda时，仅提示存在新版本4.13.0但不安装。尝试conda install conda=4.13.0时出现错误：

Solving environment: failed

UnsatisfiableError: The following specifications were found to be in conflict:
  - conda=4.13.0
  - pymc
Use "conda info <package>" to see the dependencies for each package.

尝试conda install python=3.9或conda install python=3.7时，分别出现以下错误：

# 安装Python3.9时的错误
UnsatisfiableError: The following specifications were found to be in conflict:
  - healpy -> python=3.5 -> libffi=3.2
  - healpy -> python=3.5 -> openssl=1.0
  - healpy -> python=3.5 -> readline=7
  - python=3.9

# 安装Python3.7时的错误
UnsatisfiableError: The following specifications were found to be in conflict:
  - _nb_ext_conf -> python=3.5
  - python=3.7

请问执行conda remove pymc和conda remove healpy能否解决Python3.9的升级问题？是否会破坏现有环境？有没有更优的Conda/Anaconda/Python升级方案？

更新情况 #

执行conda remove pymc后再次尝试conda install conda=4.13.0，出现新错误：

UnsatisfiableError: The following specifications were found to be in conflict:
  - conda=4.13.0 -> python[version='>=3.7,<3.8.0a0'] -> openssl[version='>=1.1.1b,<1.1.2a']
  - python=3.5

1. 仅移除pymc和healpy无法解决升级问题 #

从更新后的错误可以看出，即使删除pymc，Conda 4.13.0本身要求Python版本≥3.7，而当前base环境的Python还是3.5，这是核心冲突。仅移除pymc和healpy只能解决这两个包带来的依赖冲突，但base环境中还有其他绑定Python3.5的包（比如_nb_ext_conf），以及Python版本本身不兼容的问题，所以无法彻底解决升级到Python3.9的需求。

2. 移除pymc和healpy对现有环境的影响 #

执行conda remove pymc和conda remove healpy只会移除这两个包本身，以及直接依赖它们的其他包。如果你的现有环境中没有其他项目依赖这两个包，那么不会破坏核心环境功能；但如果有其他工具或项目依赖它们，这些依赖项也会被一并删除，可能导致相关功能无法使用。执行前可以用conda info pymc和conda info healpy查看它们的依赖关系，评估影响。

3. 更优的升级方案 #

方案一：创建全新Python3.9环境（最稳妥）

不改动原有base环境，直接新建一个独立的Python3.9环境，完全隔离旧环境的依赖冲突，命令如下：

# 创建包含Anaconda套件的Python3.9环境
conda create -n py39_env python=3.9 anaconda
# 激活新环境
conda activate py39_env

原有base环境会被完整保留，需要使用旧版本Python时，执行conda deactivate切换回去即可。如果需要旧环境中的某些包，可以在新环境中重新安装。

方案二：逐步升级base环境（风险较高）

如果一定要升级base环境，需要先清理所有绑定Python3.5的依赖包，再逐步升级：

1. 列出所有依赖Python3.5的包：

   conda list | grep "python=3.5"
   

2. 移除这些冲突包（包括_nb_ext_conf、healpy、pymc等）：

   conda remove _nb_ext_conf healpy pymc [其他冲突包名称]
   

3. 先升级Python到3.7（满足Conda 4.13.0的最低要求）：

   conda install python=3.7
   

4. 升级Conda到最新版本：

   conda update conda
   

5. 最后升级到Python3.9：

   conda install python=3.9
   

注意：此方法可能导致base环境中很多原有工具失效，建议先备份环境配置（conda env export > base_env_backup.yml）。

方案三：重新安装Anaconda/Miniconda（彻底解决）

直接下载对应Python3.9的最新版Anaconda/Miniconda安装程序，覆盖现有安装路径（提前备份重要项目和环境配置），或者安装到新路径。这种方法能完全摆脱旧环境的依赖问题，获得最干净的最新环境。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者cmm0052