使用tidymodels调用fit函数时为何出现报错？

问题背景 #

尝试生成模型拟合结果时，触发以下错误：

Error in apply(x$counts, 1, min) : must have a positive greeting

提供的可复现代码：

model <- linear_reg() %>%
  set_engine("lm")

base_wf <- workflow() %>%
  add_model(model)

formula_wf <- base_wf %>%
  add_formula(mpg ~ cyl + log(disp))

fit(formula_wf, mtcars)

核心问题说明 #

你给出的可复现代码无法触发上述错误：这段代码基于tidymodels工具链拟合线性回归，使用mtcars数据集的数值型变量，运行后能正常输出拟合结果，完全不涉及apply(x$counts, 1, min)这类针对计数矩阵的操作。

错误来源推测 #

你看到的错误提示存在明显异常（must have a positive greeting应为拼写错误，正确提示大概率是must have a positive length），这类错误通常出现在处理计数型数据集的场景中（比如基因表达分析里的count矩阵），比如使用edgeR等包时，若矩阵中存在全0行、空行或非正数值，就会触发该提示。

可能的触发原因：

• 错误信息与实际运行的代码不匹配，你可能误粘贴了另一段处理计数数据的代码的错误；
• R环境中存在同名对象冲突：比如提前赋值了名为x的计数矩阵对象，导致当前代码执行时意外调用了该对象；
• 包版本或依赖冲突，但这不会直接导致这类和计数矩阵强相关的错误。

验证建议 #

1. 重新运行你提供的代码，确认是否能正常输出拟合结果；
2. 检查当前R环境中的对象列表（用ls()），确认是否存在名为x的计数类对象；
3. 若实际是处理计数数据时触发错误，提供对应场景的可复现代码。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Tayane Varela