如何在Pandas中合并多个TXT文件并添加文件名作为新列

方法1：Shell命令（Linux/macOS环境） #

类Unix系统下可直接用命令快速完成合并与格式化：

基础快速版 #

echo "Samplename   value1       value2       value3       value4" > merged_result.txt && awk '{print FILENAME "\t" $0}' {1..65}.txt >> merged_result.txt

列对齐美观版 #

如果需要更整齐的排版，用printf控制列宽：

echo -e "Samplename   value1       value2       value3       value4" > merged_result.txt && awk '{printf "%-10s %-12s %-12s %-12s %-12s\n", FILENAME, $1, $2, $3, $4}' {1..65}.txt >> merged_result.txt

说明：

• 先将表头写入结果文件merged_result.txt
• awk自动遍历1-65号txt文件，通过FILENAME获取当前文件名，与每行内容拼接后追加到结果文件
• %-10s这类格式表示左对齐、固定宽度的字符串，确保列对齐整齐

方法2：Python脚本（跨平台通用） #

适合Windows或不熟悉Shell的用户，创建如下脚本：

# 定义输出表头
header = "Samplename   value1       value2       value3       value4"

# 打开结果文件写入
with open("merged_result.txt", "w", encoding="utf-8") as out_file:
    out_file.write(header + "\n")
    
    # 遍历1到65号文件
    for file_num in range(1, 66):
        file_name = f"{file_num}.txt"
        try:
            with open(file_name, "r", encoding="utf-8") as in_file:
                for line in in_file:
                    line_content = line.strip()
                    # 跳过空行
                    if not line_content:
                        continue
                    # 格式化每行，保证文件名列宽度一致
                    formatted_line = f"{file_name:<10} {line_content}"
                    out_file.write(formatted_line + "\n")
        except FileNotFoundError:
            print(f"⚠️ 文件 {file_name} 不存在，已跳过")

运行方式 #

在命令行执行：

python merge_files.py

说明：

• 自动跳过文件中的空行
• 若某个编号的文件不存在，会打印警告并继续处理其他文件
• 兼容Windows、Linux、macOS全平台

内容的提问来源于stack exchange，提问作者wencheng HU