调用ggfortify的autoplot绘制PCA对象时colour与color参数问题咨询

• 使用autoplot()绘制PCA散点图时，英式拼写参数colour='Species'可按指定变量为散点正常着色；但美式拼写color='Species'会被忽略，所有点显示为黑色。

复现代码 #

library(ggfortify)
library(cowplot)

pca_res <- prcomp(iris[1:4], scale = TRUE)

british <- autoplot(pca_res, data=iris, colour='Species')
us <- autoplot(pca_res, data=iris, color='Species')

plot_grid(british, us, labels=c('colour', 'color'))

问题归属确定 #

这个问题源于ggfortify包，原因如下：

• ggplot2核心函数（如ggplot()、geom_point()）本身同时兼容英式colour和美式color参数，不存在拼写兼容问题。
• 处理PCA对象的autoplot.prcomp()方法由ggfortify提供，该方法的参数定义仅声明了colour，未对美式拼写color做参数映射处理，导致color被识别为未知参数直接忽略，无法传递到后续绘图逻辑中。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者C. Murtaugh