GeoTcgaData包1.1.0版本中fpkmToTpm_matrix函数找不到的问题咨询
报错原因分析
- 函数名拼写错误:检查函数名大小写或拼写是否准确,比如包内实际函数可能是
fpkmToTpm_matrix(注意小写的tpm),而非你调用的fpkmToTPM_matrix,大小写差异会导致R无法识别函数。 - 包版本适配问题:你使用的GeoTcgaData 1.1.0版本中可能尚未收录该函数,这个函数可能是后续版本新增的,或是旧版本中函数名有差异。
- 包未正确加载:即使你认为已加载包,也可以通过
library(GeoTcgaData)重新加载,再用ls("package:GeoTcgaData")列出包内所有函数,确认是否存在目标函数;同时用packageVersion("GeoTcgaData")验证当前包版本是否为1.1.0。 - 函数归属错误:该函数可能不属于GeoTcgaData包,而是来自其他关联的依赖包,需要确认函数的所属包,加载对应包后再尝试调用。
内容的提问来源于stack exchange,提问作者NPC
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