如何使用JQAssistant Git插件一次性扫描多个Git仓库？

我在使用JQAssistant Git插件搭配属性文件扫描器时遇到了以下场景：
父目录Parent_Directory下存在N个独立的Git仓库，目录结构如下：

Parent_Directory
 |- Repository_A
 |  |- .git
 |  |- Folder
 |     |- File.properties
 |- Repository_B
    |- .git
    |- Folder
       |- File.properties

由于Git插件每次扫描必须对应单个.git文件夹，无法直接扫描父目录Parent_Directory，只能逐个扫描每个仓库。但这里存在一个问题：不同仓库中路径和文件名完全相同的属性文件无法识别所属仓库——Git仓库节点可以关联至:Repository标签确认归属，但属性文件没有被标记:Git:Properties标签，存在大量未标记:Git的:File节点，可通过以下Cypher查询找到这些节点：

MATCH (n:File)
WHERE NOT n:Git 
RETURN n

该问题不仅出现在搭配属性文件扫描器时，在Git插件搭配Json、Yaml、XML等扫描器时也会出现。我有两个疑问：

• 是否存在通过扫描父目录一次性扫描多个仓库的解决方案？
• 若没有上述方案，能否让Git插件配合其他扫描器时，自动为所有文件打上:Git相关标签？

内容的提问来源于stack exchange，提问作者hmozaffari