Snakemake中‘pop’是否为保留名？7.12.1版本报错问询

是的，pop确实在Snakemake 7.12.1版本中成为了内部保留名称，禁止用作输入、输出、通配符、params或log的命名。

• 你之前使用无异常，是因为Snakemake在更早版本中未对这个名称做保留限制；后续版本更新时，内部逻辑引入了对pop的使用（可能关联Python内置的列表pop()方法，或是新增的内部流程变量），同时强化了命名冲突检查，因此现在会触发报错。
• 目前官方手册可能未及时更新这个新增的保留名条目，但运行时的报错信息已经明确说明它属于内部保留使用范畴。

解决办法很简单，像你已经做的那样，将pop替换为其他无冲突的名称即可，比如pop_id、population、pops这类清晰指代种群的命名。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Maya_Cent