如何在ggplot2中按sample_id为行、method为列分面绘图

直接修改facet_grid()的参数顺序，把行变量放在波浪线~左侧，列变量放在右侧即可：

# 基于你的基础绘图逻辑修改分面参数
ggplot(your_data, aes(x = ref_normalised_count, y = normalised_count)) +
  geom_point() +
  # 指定sample_id为行维度，method为列维度
  facet_grid(sample_id ~ method)

这种写法会严格按照sample_id的类别生成10行，method的类别生成3列的分面矩阵，完全匹配你的需求。如果后续需要更灵活的布局调整，也可以用facet_wrap(vars(sample_id, method), nrow = 10, ncol = 3)，但facet_grid()更贴合“行-列对应指定变量”的明确需求。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Ishan Mehta