如何为ggplot2的geom_point()指定颜色、图例顺序及解决点形状问题

一、自定义颜色与调整图例顺序 #

你之前的错误是把scale_color_manual()放在了geom_point()的aes()参数内部——aes()仅用于映射数据列到美学属性，而scale类函数是独立的图层配置项，需要放在ggplot链条的外层。同时要调整图例顺序，有两种可行方案：

方案1：将z转为有序因子（修改原数据） #

先把分类变量z转为指定顺序的有序因子，ggplot会自动沿用这个顺序生成图例：

# 转换z为有序因子，指定顺序为Good>Okay>Poor>Bad
df$z <- factor(df$z, levels = c("Good", "Okay", "Poor", "Bad"), ordered = TRUE)

# 绘图代码
df %>% 
  ggplot(aes(y, x))+
  geom_point(aes(color = z))+ # 不需要size=NULL，不映射size直接省略该参数
  scale_color_manual(values = c(
    "Good" = "green",
    "Okay" = "blue",
    "Poor" = "black",
    "Bad" = "red"
  ))+
  geom_smooth(method = lm, se = FALSE)+
  labs(x = "Coded Value", y = "Percent", title = "Effects of Change")+
  theme_minimal()

方案2：在scale_color_manual中指定breaks（不修改原数据） #

如果不想改动原数据，直接在scale_color_manual()里用breaks参数指定图例的显示顺序：

df %>% 
  ggplot(aes(y, x))+
  geom_point(aes(color = z))+
  scale_color_manual(
    values = c("Good" = "green", "Okay" = "blue", "Poor" = "black", "Bad" = "red"),
    breaks = c("Good", "Okay", "Poor", "Bad") # 强制指定图例顺序
  )+
  geom_smooth(method = lm, se = FALSE)+
  labs(x = "Coded Value", y = "Percent", title = "Effects of Change")+
  theme_minimal()

二、解决shape=16的报错问题 #

报错Error: A continuous variable can not be mapped to shape的原因是你误将shape=16放在了aes()内部（当成了数据映射），或者错误地把shape映射到了连续变量。正确的用法分两种情况：

情况1：给所有点设置固定形状16 #

如果要统一使用形状16，把shape=16放在aes()外面，作为geom_point()的全局参数：

geom_point(aes(color = z), shape = 16)

情况2：将shape映射到离散变量 #

如果需要根据某个离散变量（比如z）设置不同形状，确保映射的变量是离散类型（因子或字符），放在aes()内部：

geom_point(aes(color = z, shape = z)) # z是离散分类变量，可正常映射

注意：shape美学属性仅支持离散变量映射，不能映射连续变量（比如x、y这类数值型列）。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Tathagato