为何adonis2与capscale的ANOVA结果存在差异？

我首次发帖未通过R生态统计组，且无法直接联系Jari Oksanen。目前遇到的问题是：在vegan 2.6-2包中，adonis2与capscale输出的PERMANOVA表格里，平方和（SumOfSqs）及F统计量存在差异。

当前使用环境：

• R版本：v4.2.0
• vegan包版本：2.6-2

adonis2分析步骤及结果 #

我基于Bray-Curtis距离，对三个不同处理样地的树叶枯落物物种组成进行单因素PERMANOVA分析，代码如下：

area.differences=adonis2(tree.leaf.species~Area, method="bray",data=area)

得到的PERMANOVA表格显示：

• Area项：Df=1，SumOfSqs=4.0083，F=20.977
• 残差项：Df=27，SumOfSqs=2.5796

capscale分析步骤及结果 #

为获取排序所需的样本和物种得分，我使用capscale函数：

dbRDA.one.way.area=capscale(tree.leaf.species~Area, distance="bray", data=area)

原本认为二者结果应完全一致，但调用anova(dbRDA.one.way.area)得到的结果为：

• 模型项：SumOfSqs=4.0333，F=16.023
• 残差项：Df=27，SumOfSqs=3.3981

旧版本情况 #

在R v3.2.4、vegan包2.4-5中执行相同分析，ANOVA表格无差异。

请问导致这种平方和与F值差异的原因是什么？

感谢
Steve

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Steve Brewer