绘制ROC曲线时R报‘unused arguments’错误求助

这个报错的核心原因是其他R包中的roc函数覆盖了pROC包的同名函数——其他包的roc不支持plot、legacy.axes这些参数，导致传入后被判定为无效参数。

解决步骤 #

1. 确认当前使用的roc函数来源 #

运行以下代码查看哪个包的roc在生效：

find("roc")

如果输出结果中包含pROC以外的包（比如ROCR、caret），说明该包的roc函数正在覆盖pROC的版本。

2. 显式调用pROC的roc函数 #

修改你的代码，直接指定使用pROC包的roc函数，避免被其他包干扰：

y1 <- as.integer(E_SOFA_StudyPop$`Dead within 28 d (1/0)`)
x <- as.integer(E_SOFA_StudyPop$`3h total SOFA`)

par(pty = "s")
roc.a <- pROC::roc(y1, x, plot = TRUE, legacy.axes = TRUE, lwd = 4, add = TRUE, col = "darkred")

3. 更稳妥的分步写法（推荐） #

如果需要绘制多条ROC曲线或更精细控制绘图参数，建议先创建ROC对象，再单独调用绘图函数：

# 创建ROC对象
roc.a <- pROC::roc(y1, x)

# 设置绘图参数并绘制
par(pty = "s")
plot(roc.a, legacy.axes = TRUE, lwd = 4, col = "darkred")
# 若要添加第二条曲线，再调用plot(roc.b, add=TRUE, ...)

4. 排查版本问题 #

如果上述方法仍无效，检查pROC版本并重装最新版：

# 查看当前版本
packageVersion("pROC")
# 重装最新版
install.packages("pROC")

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Gustaf Smitt Einarson