如何在ggplot的geom_smooth中限制GAM模型的最大自由度？

• 直接通过geom_smooth()的method.args参数，给gam方法传递k参数即可，以此限制自由度，让ggplot的拟合结果和你单独使用mgcv包gam()函数时一致。
• 针对你的两个数据集，分别对应设置k=9和k=4，示例代码如下：

# 处理含9个观测值的数据集
ggplot(your_data_9, aes(x = 自变量列名, y = 因变量列名)) +
  geom_point() +
  geom_smooth(method = "gam", method.args = list(k = 9), formula = y ~ s(x))

# 处理含4个观测值的数据集
ggplot(your_data_4, aes(x = 自变量列名, y = 因变量列名)) +
  geom_point() +
  geom_smooth(method = "gam", method.args = list(k = 4), formula = y ~ s(x))

• 注意：代码里的formula = y ~ s(x)是mgcv中gam模型常用的平滑项形式，如果你之前单独用gam()时用了其他平滑函数或公式，替换成对应的形式即可。

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Barbara Perez de Araújo