Docker化R Shiny应用时如何保留项目目录结构？

我构建了一个具有如下目录结构的R Shiny应用：

->Dockerfile  
->install_packages.R  
->app (Folder) 
->app/global.R  
->app/ui.R  
->app/server.R  
->app/R (Folder)  
->app/R/Folder A with further subfolders with server/ui scripts  
->app/R/Folder B with further subfolders with server/ui scripts 

本地运行该应用时，我在global.R中通过如下方式调用子目录中的脚本：

source("R/Folder A/MyScript_UI.R") 

但使用如下Dockerfile将应用Docker化后，目录结构似乎“丢失”，需要改为如下方式才能调用文件：

source("Folder A/MyScript_UI.R")  

这非常不便，因为开发时要用source("R/...)，部署时却要删除"R/"。请问我哪里操作错误？

Dockerfile内容如下：

FROM rocker/shiny:latest

RUN apt-get update && apt-get install -y --no-install-recommends \
    sudo \
    pandoc \
    pandoc-citeproc \
    libcurl4-gnutls-dev \
    libcairo2-dev \
    libxt-dev \
    libssl-dev \
    libssh2-1-dev \
      libxml2 \
      libglu1-mesa\
    && rm -rf /var/lib/apt/lists/*

COPY install_packages.R /install_packages.R

RUN Rscript /install_packages.R

COPY ./app/* /home/app/

EXPOSE 3838

CMD ["R", "-e", "shiny::runApp('/home/app', host = '0.0.0.0', port = 3838)"]

原因与解决方法 #

错误原因 #

问题出在Dockerfile的COPY命令：

COPY ./app/* /home/app/

这个命令会把app目录下的所有内容（包括R文件夹）直接平铺到/home/app/根目录，破坏了原本app/R的层级结构——本地的app/R/Folder A在容器里变成了/home/app/Folder A，自然找不到R/开头的路径。

修正方法 #

方法1：修正COPY命令（最直接）

把COPY命令改成复制整个app目录到目标路径，保留原层级：

COPY ./app /home/app/

复制完成后，容器内的目录结构和本地完全一致：

/home/app/
->global.R  
->ui.R  
->server.R  
->R (Folder)  
->R/Folder A...
->R/Folder B...

此时global.R里的source("R/Folder A/MyScript_UI.R")在本地和Docker环境中都能正常工作，无需修改路径。

方法2：使用通用路径写法（兼容多环境）

如果想从代码层面避免路径问题，可以在global.R中用基于应用根目录的路径：

# 用here包获取应用根目录（需先安装here）
source(here::here("R", "Folder A", "MyScript_UI.R"))

# 或者不用第三方包的写法
app_root <- dirname(sys.frame(1)$ofile)
source(file.path(app_root, "R", "Folder A", "MyScript_UI.R"))

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Elena