R Markdown中fromJSON转JSON为数据框报错：缺少'txt'参数

问题根源 #

你同时加载了rjson和jsonlite两个包，二者都包含名为fromJSON的函数。当前实际调用的是rjson的fromJSON——这个函数不支持file参数，必须通过txt参数传入JSON文本内容，因此触发了缺失参数的报错。

解决方案 #

方案1：明确指定使用jsonlite的fromJSON #

通过包名+双冒号的方式避免函数名冲突，同时jsonlite更适合将JSON转换为数据框：

# 安装并加载jsonlite（无需同时保留rjson）
install.packages("jsonlite")
library(jsonlite)

# 明确调用jsonlite的fromJSON
dfjson <- jsonlite::fromJSON(file= "/Users/sarah/JSON/fhir_dstu2/Aaron697_Stiedemann542_41166989-975d-4d17-b9de-17f94cb3eec1.json")
dfjson
str(dfjson)

方案2：移除rjson的加载 #

如果不需要rjson功能，直接卸载或不加载该包，仅保留jsonlite：

# 若不再需要rjson，可卸载它
remove.packages("rjson")

# 仅加载jsonlite
install.packages("jsonlite")
library(jsonlite)

# 正常调用fromJSON
dfjson <- fromJSON(file= "/Users/sarah/JSON/fhir_dstu2/Aaron697_Stiedemann542_41166989-975d-4d17-b9de-17f94cb3eec1.json")

方案3：强制使用rjson（不推荐） #

若必须用rjson，需先读取文件内容再传入txt参数：

library(rjson)
# 读取JSON文件内容
json_content <- readLines("/Users/sarah/JSON/fhir_dstu2/Aaron697_Stiedemann542_41166989-975d-4d17-b9de-17f94cb3eec1.json", warn = FALSE)
# 传入txt参数
dfjson <- fromJSON(txt = json_content)

内容的提问来源于stack exchange，提问作者Sarah